巴彦淖尔市审计局在开展审前调查的基础上，重点关注八个方面内容，扎实推进国家重要农畜产品生产基地建设专项审计。
一是关注粮食生产功能区内粮食作物耕种情况。重点关注粮食生产功能区是否精准至地块，是否掌握粮食生产功能区内种植结构及产量，是否对粮食生产功能区划定地块、目标作物面积、粮食产量等情况进行全程跟踪、动态监测管理；是否存在擅自调整粮食生产功能区、违规将粮食生产功能区纳入退耕还林还草范围问题。
二是关注优质高效增粮示范行动落实情况及粮食生产任务完成情况。重点关注粮油单产提升行动资金拨付情况，有无“垒大户”现象，奖补对象是否与承担绿色高产高效行动任务主体重复；粮食生产任务是否明确，上级下达的生产任务是否完成，项目资金管理是否存在挤占挪用、超范围支出等情况。
三是关注高标准农田建设情况。重点关注有无勘察设计调研不充分、设计不科学合理，建设标准低、质量差、围标串标和虚假招标、层层转分包、以次充好、偷工减料、高估冒算、利益输送和工程监理质量控制不到位等问题。
四是关注耕地占补平衡情况。重点关注耕地占补平衡中存在的数量、质量、生态不平衡现象，是否存在虚报为新增耕地，虚假认定、以次充好，选址不科学等问题；补充耕地质量是否存在因设计、施工标准低导致新增耕地不具备耕作条件，无法用于粮食生产或粮食产量低等问题。
五是关注设施农业建设及管理情况。重点关注设施农业近五年存量及闲置情况，任务目标是否科学合理，项目建设内容是否符合标准，项目土地利用是否合法性，项目验收工作是否到位，是否存在设施建设完成不实、套取补贴资金的情况。
六是关注种业振兴项目管理效益情况。重点关注支持大豆、玉米和水稻等项目是否按照计划或实施方案开展，前期论证和可行性研究是否充分；是否存在配套条件不完善，导致没有按时开完工问题；监管机构是否存在监管覆盖率不足、监管执法不到位等问题。
七是关注惠农补贴发放情况。重点关注各类补贴资金兑付支付情况，是否存在滞留、截留、闲置、挪用等问题，是否存在违规享受或超范围、超标准享受惠农补贴、应享受未享受惠农补贴，是否存在以虚报面积、虚假协议等方式套取惠农补贴等问题。
八是关注农业保险补贴发放情况。重点关注农业保险费补贴审批、结算等环节，是否存在权责不清晰、审核不到位，甚至内外勾结、弄虚作假骗取农业保险保费补贴资金等问题；政策性保险投保、理赔是否存在平均理赔，虚构或者虚增保险标的、虚报出险、虚假查勘、不合理定损、违规理赔等方式骗取保险保费补贴资金等问题。